Instytut Nauk Leśnych Politechniki Białostockiej utworzony został z dniem 1 października 2019 r. jako jednostka w ramach Wydziału Budownictwa i Nauk o Środowisku. Wcześniej funkcjonował jako Zamiejscowy Wydział Leśny Politechniki Białostockiej w Hajnówce.
Zamiejscowy Wydział Leśny powstał 1 marca 2011 r. z przekształcenia Zamiejscowego Wydziału Zarządzania Środowiskiem Politechniki Białostockiej.
Studia pierwszego stopnia (inżynierskie) na kierunku leśnictwo o specjalności gospodarowanie na obszarach przyrodniczo cennych prowadzone są od 2008 r., studia drugiego stopnia (magisterskie) – od października 2019 r.
Zamiejscowy Wydział Zarządzania Środowiskiem w Hajnówce został utworzony w 2000 roku dzięki wspólnym staraniom Politechniki Białostockiej oraz samorządu hajnowskiego. Swoją działalność rozpoczął w 2002 roku.
W latach 2002-2008 Wydziałem kierowała dr hab. inż. Elżbieta Malzahn, prof. PB. W tym okresie Wydział kształcił studentów na kierunku ochrona środowiska o specjalności gospodarowanie na obszarach przyrodniczo cennych.
W dniu 28 października 2010 roku Senat Politechniki Białostockiej podjął uchwałę w sprawie zmiany nazwy Wydziału w Hajnówce.